在设置中，你可以让 InnerPulse 适应你的节奏。各部分按主题分组，顺序与应用中出现的顺序一致：外观、通用、安全与数据、影响因素、关于。最上方是概览这一行。规模较大、较为复杂的内容拥有独立章节，在这里只简短提及。
概览
设置的第一行会打开概览。这个页面显示最重要设置的当前状态：
- 提醒： 日记提醒的时间或已关闭，下方是问卷间隔。
- 应用锁： 你可以直接在这个页面更改超时。
- 智能因素： Apple Health 和天气是开启还是关闭。
- 因素： 你启用的因素数量。
- 存储空间： 你的条目数量，以及照片和文件占用的空间。
- 设备同步： 已开启或已关闭；开启同步时还显示上次同步的时间。
除应用锁外，每一行都会打开对应的页面。在分屏中，也就是横握 iPad 或 iPhone Duo 的书本形态下，打开设置时右栏会显示这个页面。
外观
在外观部分中你设置主题。
主题
提供四种主题：
- Still Water： 平静的青绿色，浅色。
- Paper & Ink： 温暖的米色调，浅色。
- Night Owl： 靛蓝渐变，深色。
- Legacy： 跟随系统设置，自动浅色或深色。
每个主题都带有自己的情绪调色板，让情绪颜色即使在彩色背景下也保持可读。切换通过约半秒的柔和淡入淡出完成，而不是硬切换。选择本地保存在 iOS 的 User Defaults 中。主题偏好没有云同步。
通用
这里你能找到语言、提醒、日记和问卷的图表设置，以及未记录日子的开关。
提醒
提醒分为两个区域：日记和问卷。
日记： 主开关加上时间选择器。下方有一个星期几条，你可以有针对性地开启或关闭某些日子。这样你可以在周末获得清静，如果愿意的话。应用只会在当天还没有条目时发送提醒。这种行为称为智能抑制，确保应用不会因你早已完成的事情而提醒你。
问卷： 间隔选择器，提供默认选项（每天、7、14、30、90 天）和自定义选项（1 到 365 天）。提醒相对于上次测试计算。如果你让测试超期，应用会每天提示你，直到你完成或停用提醒。
首次启用时，iOS 会询问通知权限。没有这个许可应用会显示一条提示。如果提醒收不到，请参见常见问题章节。
图表和条目行
在日记和问卷下，你为各自的标签选择图表样式：折线、柱状或颜色。下方设定列表各行显示的内容，例如星期几、日期、时间和笔记开头，以及日期格式。自第 6 版起，你在日记中也可以把自己的情绪放进这一行。示例行会立即显示每一处更改。
显示未记录的日子
同样在通用下面有一个显示未记录的日子开关。开启后，日记会把没有条目的日子作为淡色虚线卡片显示出来。点击它会为正好这一天创建一条条目。这个功能刻意保持无负罪感，没有连续天数，也没有提示音。它在日记中是什么样子，参见情绪日记章节。
安全与数据
在这一部分你能找到应用锁和隐私中心。
应用锁
在安全下面你开启生物识别锁。设置超时：从不、立即、1 分钟、5 分钟或 15 分钟。超时后，下次打开应用时会要求 Face ID、Touch ID 或设备密码。锁屏在验证成功之前不显示应用的任何内容。更多背景见隐私与安全章节。
隐私中心
点击隐私与数据进入隐私中心。在那里你能看到条目和问卷的计数，可以导出数据、导入数据或删除一切。应用使用哪些权限以及删除时会发生什么，请参见隐私与安全章节。导出和导入的细节见导出数据章节。
设备同步
隐私中心里有设备同步这一行。你可以在那里通过在此设备上同步开启 iPhone 和 iPad 之间可选的端到端加密同步。它默认关闭，需要在每台设备上分别开启。它如何运作、同步哪些内容，见隐私与安全章节。在同一页面，同步照片和文件可加入 25 MB 以内的照片和文件；仅通过无线局域网上传默认开启。首次同步前，应用会通过要开启设备同步吗？征求你的同意。
影响因素
模式检测决定一个关联至少要出现多少次，InnerPulse 才会显示它：3、5、7 或 10，默认是 5。这个阈值适用于应用计数的所有地方：星期几规律、情绪与因素的组合，以及某个因素的相互影响。值低时更早看到结果，值高时只显示经常重复出现的内容。
因素管理可作为独立子页面进入。它有以下区域：发现的规律（应用从你的数据中识别出的星期几亲和度）、因素与类别（隐藏系统因素、创建自己的、重命名），以及智能因素（Apple Health 和天气）。
你也在这里调整单个因素。自第 4 版起，每个因素都可以编辑（标题、符号、类别、倾向），并且你可以为每个因素开启一个强度滑块，它会在条目中显示一个五档量表，取代简单的选择。
因为因素是有独立逻辑的独立概念，所以它们有自己的章节：因素。Apple Health 和天气在Apple Health与天气章节中详细介绍。
关于
在关于部分你能找到：
- 应用版本，
- 发送反馈按钮，打开 iOS 邮件编辑器（带有版本、iOS 版本和设备型号的自动页脚，便于支持团队定位），
- 在 App Store 中评分链接，打开原生评价对话框，
- 隐私政策和这个帮助页面的链接。
值得知道的事
- 系统因素你可以隐藏，但不能删除。这样可以防止因旧条目中引用隐藏因素而意外丢失数据。
- 主题、提醒、应用锁、Apple Health 和天气保留在各设备上。开启设备同步后，只有因素、类别和显示设置会同步：图表样式、行布局、条目结构和规律阈值。
- 如果提醒收不到，请在 iOS 的设置、通知、InnerPulse中检查是否允许通知并且没有专注模式启用。更多提示见常见问题章节。